MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Methanococcus vannielii SB chromosome

Total Repeats: 7339

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009634	CCG	2	6	166	171	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_009634	TTAAC	2	10	251	260	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_009634	TGG	2	6	380	385	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_009634	CCA	2	6	395	400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5	NC_009634	CGAT	2	8	407	414	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
6	NC_009634	GA	3	6	424	429	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009634	GCA	2	6	478	483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_009634	G	6	6	518	523	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
9	NC_009634	CAG	2	6	603	608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_009634	CTG	2	6	727	732	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009634	GGA	2	6	794	799	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
12	NC_009634	GGT	2	6	937	942	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_009634	CGC	2	6	965	970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
14	NC_009634	CAC	2	6	1020	1025	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_009634	ATG	2	6	1087	1092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_009634	GAC	2	6	1104	1109	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_009634	GGT	2	6	1129	1134	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
18	NC_009634	CGAG	2	8	1185	1192	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009634	ACT	2	6	1212	1217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_009634	AGGA	2	8	1265	1272	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_009634	GCT	2	6	1344	1349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_009634	GTA	2	6	1433	1438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_009634	ATA	2	6	1449	1454	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_009634	CA	3	6	1482	1487	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_009634	CAC	2	6	1498	1503	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_009634	GGCCTT	2	12	1523	1534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_009634	G	6	6	1563	1568	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009634	CCT	2	6	1614	1619	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
29	NC_009634	A	7	7	1620	1626	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_009634	CTA	2	6	1641	1646	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_009634	T	7	7	1671	1677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_009634	ATG	2	6	1723	1728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_009634	TGGCT	2	10	1798	1807	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_009634	AGGCG	2	10	1848	1857	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
35	NC_009634	TAG	2	6	1983	1988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_009634	CTT	2	6	2051	2056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_009634	CG	3	6	2172	2177	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_009634	AGGT	2	8	2295	2302	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_009634	GGC	2	6	2353	2358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_009634	GAA	2	6	2364	2369	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_009634	TCC	2	6	2386	2391	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_009634	TTG	2	6	2419	2424	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_009634	CAA	2	6	2466	2471	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009634	GTT	2	6	2594	2599	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009634	GAA	2	6	2743	2748	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_009634	GTC	2	6	2780	2785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009634	TGAG	2	8	2797	2804	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_009634	CAG	2	6	2910	2915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009634	AGC	2	6	2931	2936	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009634	G	6	6	3046	3051	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
51	NC_009634	GTA	3	9	3115	3123	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_009634	CCG	2	6	3151	3156	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_009634	TAA	2	6	3365	3370	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_009634	TGA	2	6	3390	3395	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_009634	GT	3	6	3671	3676	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_009634	CGG	2	6	3745	3750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_009634	ACC	2	6	4016	4021	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
58	NC_009634	CCT	2	6	4090	4095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_009634	AGG	2	6	4107	4112	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_009634	AGCC	2	8	4167	4174	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_009634	CAA	2	6	4187	4192	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_009634	A	6	6	4262	4267	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_009634	GCA	2	6	4361	4366	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_009634	CGT	2	6	4423	4428	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009634	GGTT	2	8	4435	4442	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_009634	CTG	2	6	4448	4453	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_009634	AGC	2	6	4549	4554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009634	AGA	2	6	4646	4651	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_009634	TTC	2	6	4686	4691	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_009634	GA	3	6	4724	4729	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_009634	TTTAA	2	10	4777	4786	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_009634	ATCCC	2	10	4826	4835	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
73	NC_009634	TA	4	8	4925	4932	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_009634	TA	3	6	4937	4942	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009634	TTGA	2	8	4943	4950	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
76	NC_009634	T	6	6	4971	4976	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_009634	A	6	6	5587	5592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_009634	A	6	6	6192	6197	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_009634	A	6	6	6208	6213	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_009634	AAT	2	6	6220	6225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_009634	T	6	6	6247	6252	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_009634	TA	3	6	6260	6265	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_009634	TAA	2	6	6273	6278	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_009634	A	6	6	7219	7224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009634	ACC	2	6	8125	8130	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_009634	TAA	2	6	8145	8150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009634	TATAA	2	10	8166	8175	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009634	CTTA	2	8	8196	8203	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_009634	AT	3	6	8234	8239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_009634	ATA	2	6	8282	8287	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_009634	AATAAA	2	12	8297	8308	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_009634	A	6	6	9217	9222	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_009634	TA	3	6	9238	9243	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009634	GAC	2	6	9320	9325	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009634	CTA	2	6	10465	10470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009634	TAAC	2	8	10486	10493	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
97	NC_009634	TACT	2	8	10495	10502	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_009634	AT	3	6	10510	10515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_009634	AAT	2	6	10520	10525	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009634	ATT	2	6	10532	10537	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_009634	T	6	6	10806	10811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009634	TAA	2	6	11459	11464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_009634	AAT	2	6	11465	11470	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_009634	ACTAT	2	10	11480	11489	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
105	NC_009634	T	7	7	11489	11495	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_009634	ATTT	2	8	11501	11508	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009634	TA	3	6	11510	11515	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_009634	AT	4	8	11964	11971	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009634	ATATTT	2	12	12895	12906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_009634	TAT	3	9	12923	12931	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_009634	AC	3	6	12933	12938	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009634	TTA	2	6	12988	12993	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_009634	TA	3	6	12995	13000	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_009634	AT	3	6	13015	13020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_009634	TGG	2	6	13024	13029	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_009634	ATAA	2	8	13436	13443	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_009634	TAAAC	3	15	14431	14445	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009634	ATTA	2	8	14474	14481	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_009634	TGG	2	6	14509	14514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_009634	ATA	2	6	15123	15128	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_009634	A	6	6	15152	15157	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_009634	AGG	2	6	16204	16209	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
123	NC_009634	ATT	2	6	16265	16270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009634	T	8	8	16269	16276	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009634	TTA	2	6	16344	16349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_009634	TAA	2	6	16398	16403	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009634	TATTTA	2	12	16404	16415	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_009634	TA	3	6	16430	16435	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_009634	TAAAA	2	10	16720	16729	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_009634	AAAT	2	8	16751	16758	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_009634	T	6	6	17177	17182	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_009634	CTA	2	6	17183	17188	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009634	AATTT	2	10	17196	17205	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_009634	GAT	2	6	17224	17229	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
135	NC_009634	AT	3	6	18295	18300	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_009634	AT	4	8	18305	18312	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_009634	AT	4	8	18317	18324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_009634	CAC	2	6	19693	19698	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_009634	GTT	2	6	19709	19714	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_009634	A	6	6	19722	19727	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_009634	AT	3	6	19749	19754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009634	AAAT	2	8	19755	19762	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_009634	A	7	7	19767	19773	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_009634	TA	3	6	19774	19779	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_009634	A	6	6	19796	19801	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_009634	ATT	2	6	21067	21072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_009634	AAT	2	6	21075	21080	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_009634	TA	3	6	21098	21103	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_009634	TGATT	2	10	21127	21136	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
150	NC_009634	TAAA	2	8	21139	21146	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_009634	AAT	2	6	22460	22465	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_009634	AAACT	2	10	22486	22495	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
153	NC_009634	T	6	6	23127	23132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_009634	AT	3	6	23518	23523	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_009634	ATTT	2	8	23527	23534	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_009634	AT	3	6	23541	23546	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
157	NC_009634	ATAA	2	8	23559	23566	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
158	NC_009634	A	6	6	23580	23585	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_009634	AAT	2	6	23612	23617	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
160	NC_009634	A	6	6	23628	23633	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_009634	ATT	3	9	23667	23675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_009634	ATT	2	6	23681	23686	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
163	NC_009634	TA	3	6	24651	24656	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_009634	AAATTT	2	12	26303	26314	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_009634	AATT	2	8	26322	26329	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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171	NC_009634	TAC	2	6	26533	26538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_009634	TTCCT	2	10	26541	26550	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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176	NC_009634	TTCG	2	8	27290	27297	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
177	NC_009634	T	6	6	27328	27333	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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181	NC_009634	ATT	2	6	29746	29751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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186	NC_009634	ATTA	2	8	29852	29859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
187	NC_009634	ATT	2	6	29864	29869	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_009634	A	7	7	29886	29892	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
189	NC_009634	A	6	6	29922	29927	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
190	NC_009634	A	6	6	29941	29946	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_009634	TTA	2	6	30920	30925	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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273	NC_009634	ATCA	2	8	49398	49405	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
274	NC_009634	T	6	6	49454	49459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_009634	TTATTT	2	12	49580	49591	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_009634	T	6	6	50052	50057	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_009634	ATT	2	6	50066	50071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
284	NC_009634	A	6	6	50078	50083	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_009634	TAT	2	6	50114	50119	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
286	NC_009634	A	7	7	50140	50146	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_009634	TAAA	2	8	50156	50163	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_009634	A	6	6	50186	50191	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
289	NC_009634	AT	3	6	50196	50201	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
290	NC_009634	AAT	2	6	50213	50218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
291	NC_009634	TTA	2	6	50299	50304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_009634	TTA	2	6	50309	50314	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
293	NC_009634	TTA	2	6	50319	50324	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
294	NC_009634	TTA	2	6	50329	50334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_009634	TTA	2	6	50349	50354	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
297	NC_009634	TTA	2	6	50359	50364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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434	NC_009634	TAT	2	6	105155	105160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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439	NC_009634	TTGG	2	8	105269	105276	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_009634	AAC	2	6	105306	105311	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
442	NC_009634	TCTAAG	2	12	105327	105338	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
443	NC_009634	ATC	2	6	105343	105348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
444	NC_009634	TTAAT	2	10	105372	105381	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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449	NC_009634	AT	3	6	106838	106843	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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451	NC_009634	TTA	2	6	106893	106898	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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